Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23AQ15436 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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