Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC3Q15034 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC3Q15034 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms