Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
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SHPRHQ149N8 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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SHPRHQ149N8 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
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SHPRHQ149N8 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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