Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms