Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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