Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RBM39Q14498 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBM39Q14498 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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