Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCINQ13939 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms