Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHROOM2Q13796 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms