Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL1Q13616 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL1Q13616 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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CUL1Q13616 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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CUL1Q13616 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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CUL1Q13616 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL1Q13616 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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