Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PICALMQ13492 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PICALMQ13492 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms