Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SP140Q13342 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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