Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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