Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms