Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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