Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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