Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPRL3Q12980 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms