Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms