Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RPS29P62273 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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