Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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