Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms