Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms