Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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