Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms