Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srd5a3Q9WUP4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms