Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clcf1Q9QZM3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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