Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l2Q9JLG4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms