Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms