Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ush1cQ9ES64 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ush1cQ9ES64 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ush1cQ9ES64 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms