Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms