Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms