Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms