Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erp27Q9D8U3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms