Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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