Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms