Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms