Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rpl39lQ9CQD0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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