Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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