Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim11Q99PQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim11Q99PQ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms