Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl1Q99N96 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms