Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp4Q99ME9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms