Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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SmagpQ99KC7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SmagpQ99KC7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SmagpQ99KC7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SmagpQ99KC7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SmagpQ99KC7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SmagpQ99KC7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SmagpQ99KC7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SmagpQ99KC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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