Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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