Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf8Q8VC56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf8Q8VC56 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf8Q8VC56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf8Q8VC56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf8Q8VC56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf8Q8VC56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf8Q8VC56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms