Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sash3Q8K352 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sash3Q8K352 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms