Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkd3Q8K1Y2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms