Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne5Q8JZW4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms