Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc28bQ8CEG5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms