Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms