Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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