Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnkQ7TSL0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms